OS環境を整えていたら、Desigeon編集ツールの表示が乱れていることに気づきました。
チェックボックスのみならず、表計算風のウィンドウ（エネミー能力値など）ではコントロールの表示位置が乱れるようです。
こういうときは同じフォルダに入っているK3DEdit.exe.manifestファイルを削除もしくは名前変更してくださるようお願いします。デザインはクラシックになりますがやむを得ません。
チェックボックスについては正しく表示される箇所もあるので、アプリ的に対策ができるのだと思いますが、今は対策する余力がありません。